熱空氣消毒箱是利用高溫使微生物細胞內的蛋白質凝固變性而達到滅菌的目的。

細胞內的蛋白質凝固性與其本身的含水量有關，在菌體受熱時，當環境和細胞內含水量越大，則蛋白質凝固就越快，反之含水量越小，凝固緩慢。

因此，與濕熱滅菌相比，所需溫度高。但溫度不能超過。　　

下面說說熱空氣消毒箱的方法：裝入待滅菌物品，將包好的待滅菌物品（培養皿，試管，吸管等）放入內，關好箱門。

升溫接通電源，撥動開關，打開排氣孔，旋動恒溫調節器，讓溫度逐漸上升。當升至一定溫度時，關閉排氣孔。在升溫過程中，如果蜂鳴聲響起，表示箱內停止加溫，此時達到所需的溫度。

當升到一定溫度時，借恒溫調節器的自動控制，保持此溫度。切斷電源、自然降溫。待內溫度降到70℃以下后，打開箱門，取出滅菌物品。　　

利用高溫干熱對微生物有氧化、蛋白質變性、電介質濃縮引起中毒等作用，其中主要是通過氧化作用破壞細胞原生質，使微生物死亡，所以在一定的加熱時間內可殺死一切微生物。